More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3683 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 248 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  95.56 
 
 		 248 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  95.16 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  93.55 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  79.03 
 
 		 239 aa  400  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 239 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 239 aa  380  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  74.19 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  73.39 
 
 		 239 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  62.89 
 
 		 250 aa  314  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  61.51 
 
 		 252 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  58.23 
 
 		 235 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  53.04 
 
 		 240 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  51.21 
 
 		 240 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  54.47 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  54.07 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  54.29 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.35 
 
 		 240 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  43.55 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 234 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 194 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  40.24 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  40.93 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  42.17 
 
 		 245 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 245 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  41.37 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  39.11 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  29.51 
 
 		 237 aa  103  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 		 367 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  31.68 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  31.1 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 245 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  30.74 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  28.57 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  31.75 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  32.54 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.68 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.74 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.47 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.72 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  27.09 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  29.84 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  27.09 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.4 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.83 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  26.22 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  28.46 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  27.38 
 
 		 244 aa  72  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 264 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  27.56 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5067  short chain dehydrogenase  26.98 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325095  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  28.24 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  28.06 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4768  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  27.17 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0269  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.7 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4682  short chain dehydrogenase  28.04 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138307  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.1 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>