More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10270 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 262 aa  530  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  70.85 
 
 		 236 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  73.14 
 
 		 234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  72.31 
 
 		 234 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  68.83 
 
 		 236 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  66.8 
 
 		 236 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  67.21 
 
 		 236 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  54.88 
 
 		 237 aa  258  9e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  46.56 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  45.75 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 		 239 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  46 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  48.97 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 240 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  45.75 
 
 		 240 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 		 230 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 248 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 		 194 aa  178  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  41.74 
 
 		 245 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  39.17 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 245 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  38.93 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.83 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  32.95 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  31.17 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  29.27 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  32.16 
 
 		 249 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.83 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  31.75 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  31.75 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  33.47 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  30.29 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  30.8 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  29.3 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.13 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.41 
 
 		 259 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  30.24 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  29.96 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  29.96 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  27.46 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  30.86 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.02 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  31.25 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  28.74 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.24 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  29.92 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  27.92 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>