More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3167 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 
268 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
247 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  37.75 
 
 
263 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
258 aa  143  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.91 
 
 
248 aa  142  4e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
242 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  35.17 
 
 
261 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
251 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
237 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
264 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 
331 aa  138  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  35.54 
 
 
254 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  36.48 
 
 
256 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  33.98 
 
 
257 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  36.71 
 
 
255 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.33 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  32.77 
 
 
264 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.71 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  42.05 
 
 
231 aa  133  3e-30  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
255 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  33.33 
 
 
245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  34 
 
 
277 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  33.33 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
262 aa  129  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  33.2 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
258 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  34.87 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
255 aa  125  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  35.71 
 
 
249 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  34.4 
 
 
266 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
264 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  31.97 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  35.66 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
255 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 
272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
237 aa  119  7e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  35.66 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  32.93 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.76 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.324662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  35.25 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  32.5 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
255 aa  115  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  32.53 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 
247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  30.89 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
254 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.17 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
246 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
246 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.89 
 
 
248 aa  108  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.86 
 
 
246 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  33.05 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.04 
 
 
245 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.05 
 
 
263 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  29.27 
 
 
272 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
246 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
257 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  32.35 
 
 
252 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  32.28 
 
 
265 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.35 
 
 
250 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
246 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.82 
 
 
246 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.07 
 
 
246 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>