More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1465 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 290 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.71 
 
 		 261 aa  381  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.89 
 
 		 255 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.99 
 
 		 261 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.3 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.21 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.91 
 
 		 262 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.59 
 
 		 273 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.49 
 
 		 270 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 		 266 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  52.57 
 
 		 267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  50.97 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  50.8 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 		 272 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  54.25 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  47.37 
 
 		 272 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  43.46 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 256 aa  172  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  43.44 
 
 		 257 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  42.21 
 
 		 286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  40.83 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  39.09 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  41.15 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.83 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  38.59 
 
 		 331 aa  158  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 		 258 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.8 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.4 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.53 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  33.88 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  38.66 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 237 aa  136  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 267 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  39.18 
 
 		 245 aa  132  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 		 253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 242 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  35.63 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.65 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  37.94 
 
 		 245 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  37.55 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  37.16 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  37.35 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  34.4 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  35.34 
 
 		 246 aa  114  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  34.27 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 263 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.75 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  30.74 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.62 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  31.47 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  32.13 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.131305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.16 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  28.02 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  34.38 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>