More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1021 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  91.1 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  71.37 
 
 		 234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  71.37 
 
 		 234 aa  350  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  69.07 
 
 		 236 aa  345  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  67.21 
 
 		 262 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  58.65 
 
 		 237 aa  284  8e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.43 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 240 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  49.13 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  46.86 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  44.9 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  45.61 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  46.44 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  45.68 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  44.76 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  43.23 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  43.95 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  49.22 
 
 		 194 aa  184  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  43.1 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  43.78 
 
 		 245 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  42.67 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  37.66 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.91 
 
 		 238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.74 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.06 
 
 		 260 aa  95.1  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  32.77 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  31.51 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 256 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  29.63 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  30.33 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  31.33 
 
 		 245 aa  85.9  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  28.75 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  29.46 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  26.64 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  27.57 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  29.63 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  25.83 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  29.55 
 
 		 253 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  29.63 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  29.34 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  29.15 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  29.55 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  29.15 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  28.74 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  28.74 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  30.16 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1043  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.53 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00108019  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5602  glucose-1-dehydrogenase  29.15 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.21 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  27 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1003  glucose-1-dehydrogenase  29.55 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.47 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.85 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  28.27 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.58 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  28.46 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  27.31 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1035  glucose-1-dehydrogenase  29.1 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  27.97 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.94 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.38 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  23.11 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  29.83 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  23.11 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.82 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>