More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3287 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  52.14 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  52.54 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  49.57 
 
 		 240 aa  238  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  50.43 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  50.85 
 
 		 237 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  51.69 
 
 		 239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  51.69 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  57.65 
 
 		 194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  51.69 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  51.69 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 		 235 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  51.06 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  48.35 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  50.43 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  49.57 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  47.76 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  47.35 
 
 		 248 aa  215  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  47.35 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  46.41 
 
 		 252 aa  214  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  41.38 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 		 245 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  39.24 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  39.74 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  35.37 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  29.39 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  28.51 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 		 246 aa  101  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  28.93 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  29.05 
 
 		 251 aa  101  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  25 
 
 		 237 aa  99.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  27.76 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 248 aa  95.5  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 367 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  29.32 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.32 
 
 		 259 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  29.22 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 256 aa  92  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  28.16 
 
 		 331 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 264 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  27.69 
 
 		 254 aa  89  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  27.89 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.75 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.73 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  26.75 
 
 		 246 aa  86.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  29.67 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  29.67 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  26.14 
 
 		 277 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  31.28 
 
 		 246 aa  85.9  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  28.29 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.03 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  26.56 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  27.94 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  27.95 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.51 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  27.31 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  27.2 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0994  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  27.8 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150046 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.28 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.34 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  25.79 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.43 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>