More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2589 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 240 aa  493  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  76.15 
 
 		 240 aa  374  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  73.33 
 
 		 240 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  68.97 
 
 		 240 aa  333  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  319  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  66.52 
 
 		 240 aa  318  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  58.16 
 
 		 239 aa  264  7e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  56.9 
 
 		 239 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  56.9 
 
 		 239 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  56.07 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  54.73 
 
 		 239 aa  247  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  51.61 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  51.21 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  50.81 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  52.02 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  53.45 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.43 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  48.37 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  48.09 
 
 		 234 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  46.61 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  47.03 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  47.66 
 
 		 234 aa  214  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  45.8 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  47.23 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  51.28 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 		 262 aa  195  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  39.57 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  39.15 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  37.13 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  28.02 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.11 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 367 aa  108  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  33.75 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 		 242 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  35.12 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  30.83 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  30.42 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.58 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  29.32 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.75 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 245 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.73 
 
 		 260 aa  88.6  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  29.88 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  28.57 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  29.67 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.92 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  28.75 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.2 
 
 		 248 aa  85.5  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  29.46 
 
 		 331 aa  85.1  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.83 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  34.02 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  34.02 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2487  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147298  normal  0.672807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3521  oxidoreductase  28.52 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  30.58 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2758  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.3 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0263508  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 258 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.45 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.74 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  29.64 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.4 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  28.45 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  29.79 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.71 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  27.62 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21240  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.45 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.79369  normal  0.660906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  31.17 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>