More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0892 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  77.12 
 
 		 236 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  76.72 
 
 		 234 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  77.16 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 236 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  70.85 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  67.8 
 
 		 236 aa  340  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  58.55 
 
 		 237 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 		 239 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  48.12 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  49.36 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  47.28 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  48.12 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  45.41 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  47.48 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 235 aa  211  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  48.51 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  46.38 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  44.87 
 
 		 240 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 248 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  43.53 
 
 		 230 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 245 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 245 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  48.7 
 
 		 194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  39.51 
 
 		 251 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  28.57 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  33.6 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.97 
 
 		 367 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  27.73 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.96 
 
 		 251 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  28.85 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  30.74 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  29.08 
 
 		 255 aa  87  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.21 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  27.97 
 
 		 259 aa  84.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  27.54 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  30.04 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  27.73 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  26.5 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  27.73 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  27.73 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.42 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.86 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.5 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  28.15 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  29.15 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  28.15 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  26.5 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  29.24 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.11 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  29.92 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  25.41 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  30.42 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  28.1 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.81 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  28.92 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0259  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  27.04 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.99 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.43 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  29.11 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  28.68 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>