More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1995 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  55.02 
 
 		 266 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  54.86 
 
 		 277 aa  271  7e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  68.18 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  53.08 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  52.69 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  48.68 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  47.19 
 
 		 276 aa  235  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 		 262 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  48.83 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.3 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 268 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  38.67 
 
 		 250 aa  169  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  38 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  38.37 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 253 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  35.69 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 		 331 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.72 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.62 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.92 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  35.18 
 
 		 245 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  31.85 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  30.97 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 		 245 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  32.43 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  33.58 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2207  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.856829 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  31.91 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  30.8 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1512  short chain dehydrogenase  29.02 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538743  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.27 
 
 		 231 aa  102  6e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.839848  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  32.81 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  28.15 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.556744  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 257 aa  99.8  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  31.34 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  30.17 
 
 		 231 aa  99  8e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  31.8 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>