More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3625 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  95.56 
 
 		 248 aa  490  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  95.56 
 
 		 248 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  93.55 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  78.23 
 
 		 239 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 239 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  75 
 
 		 239 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  74.19 
 
 		 239 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  73.39 
 
 		 239 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  62.89 
 
 		 250 aa  312  3.9999999999999997e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  62.3 
 
 		 252 aa  308  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  57.83 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 		 240 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  52.02 
 
 		 240 aa  238  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  54.07 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  50.4 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  53.66 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  54.29 
 
 		 240 aa  231  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  41.94 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  42.06 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  46.8 
 
 		 194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  40.96 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  39.52 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  29.1 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 		 367 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  31.52 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.24 
 
 		 250 aa  92.4  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  29.34 
 
 		 245 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  28.57 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  31.23 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  31.23 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  30.59 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.97 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.08 
 
 		 251 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2697  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  27.78 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.18 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  28.29 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  29.53 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  29.64 
 
 		 246 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.6 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  29.64 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  30.47 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2903  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  28.57 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  27.24 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4163  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.212071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 		 257 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.42 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674549  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 246 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2801  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.42 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  27.56 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  27.42 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.38 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  28.69 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  28.57 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  27.67 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  25.94 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.715574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  27.67 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.79 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>