More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  95.3 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  77.16 
 
 		 236 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  72.53 
 
 		 236 aa  358  5e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  72.65 
 
 		 236 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  73.14 
 
 		 262 aa  355  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  71.37 
 
 		 236 aa  350  8e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  61.18 
 
 		 237 aa  290  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.15 
 
 		 240 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  47.72 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  48.54 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  48.7 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  47.66 
 
 		 240 aa  214  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  48.32 
 
 		 240 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  47.7 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  48.12 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  48.12 
 
 		 239 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  45.3 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  43.55 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 248 aa  194  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  42.34 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 		 230 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  46.11 
 
 		 194 aa  178  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 		 252 aa  177  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  40.09 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  39.22 
 
 		 245 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  38.84 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.3 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  35.56 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  33.06 
 
 		 245 aa  100  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.83 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  29.75 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.15 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  31.65 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 		 367 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  29.41 
 
 		 259 aa  94.7  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  31.71 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3921  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  32.34 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  29.55 
 
 		 246 aa  92.8  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  33.07 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  29.91 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  30.54 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 268 aa  88.6  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  31.89 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 		 264 aa  85.5  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.5 
 
 		 246 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1713  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  26.78 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  30.49 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.31 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.442854  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  29.66 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04541  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.03 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0716484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.87 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000350545  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0665  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.94 
 
 		 246 aa  81.6  0.000000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.719138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32440  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  31.17 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  29.54 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.16 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.411552  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  24.7 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  31.15 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1295  dehydrogenase  28.21 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.73 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  25.51 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3809  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.96 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  28.99 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 		 264 aa  78.6  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  30.13 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  29.41 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  29.41 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>