More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1087 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  100 
 
 
255 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  80.78 
 
 
255 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  65.06 
 
 
259 aa  336  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  65.48 
 
 
254 aa  329  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  56.5 
 
 
331 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  54.47 
 
 
264 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  56.5 
 
 
251 aa  289  3e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  55.83 
 
 
256 aa  279  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
256 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  52.89 
 
 
268 aa  254  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
258 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
264 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 
263 aa  231  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  49 
 
 
258 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
258 aa  225  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  48.81 
 
 
257 aa  224  8e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  47.33 
 
 
250 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  47.18 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  48.61 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
261 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 
266 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  45.6 
 
 
257 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
272 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  40 
 
 
267 aa  168  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
272 aa  168  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
247 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
276 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
261 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
290 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
255 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
254 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 
272 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
264 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
262 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  40.91 
 
 
259 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
255 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
273 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
253 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
241 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
248 aa  136  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
252 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  36.29 
 
 
259 aa  132  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  36.78 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  37.08 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  34.16 
 
 
250 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
253 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  35.08 
 
 
259 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.4 
 
 
263 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.97 
 
 
267 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
247 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  33.33 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.98 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.2 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
246 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.74 
 
 
246 aa  116  3e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  32.98 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  34.16 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
267 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.66 
 
 
250 aa  112  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.66 
 
 
250 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.53 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.53 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.33 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.33 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.97 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.38 
 
 
246 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.38 
 
 
246 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.34 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
246 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.38 
 
 
246 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
246 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.38 
 
 
246 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
246 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  36.55 
 
 
260 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>