More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0103 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 270 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.52 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.05 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  66.27 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.49 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.69 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.76 
 
 		 262 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  55.26 
 
 		 266 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  55.86 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  54.96 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.11 
 
 		 261 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.46 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  52.65 
 
 		 272 aa  255  5e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  47.29 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  46.07 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  47.97 
 
 		 268 aa  201  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  46.61 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  45.2 
 
 		 256 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.44 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  40.4 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  40.74 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  37.14 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  41.28 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  39.75 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  40.5 
 
 		 261 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.14 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.31 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 267 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  38.71 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.15 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  39.84 
 
 		 246 aa  139  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  40.22 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  39.43 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  40.98 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  38.06 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.59 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  39.59 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.35 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  39.26 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  38.75 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 254 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 251 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  34.43 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  40.57 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  36.55 
 
 		 245 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  32.93 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  34.85 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  32.43 
 
 		 269 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  36.55 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.77 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  34.02 
 
 		 259 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.4 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  42.98 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>