More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0496 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.16 
 
 
261 aa  411  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.99 
 
 
290 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  78.46 
 
 
255 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.9 
 
 
255 aa  381  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.52 
 
 
262 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.94 
 
 
264 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.36 
 
 
273 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.11 
 
 
270 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  56.37 
 
 
267 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  54.18 
 
 
266 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  53.97 
 
 
277 aa  244  9e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 
272 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  56.42 
 
 
259 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  52.12 
 
 
272 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 
272 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 
276 aa  227  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  48.26 
 
 
272 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
273 aa  224  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
255 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
254 aa  202  4e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  45.71 
 
 
268 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  42.68 
 
 
261 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
264 aa  169  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  42.86 
 
 
250 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  40.57 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  39.26 
 
 
331 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
247 aa  162  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
255 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 
264 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  39.34 
 
 
256 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 
263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
252 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 
286 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
255 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  39.75 
 
 
266 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  39.75 
 
 
257 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  36.89 
 
 
254 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  42.53 
 
 
251 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  32.66 
 
 
259 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
253 aa  136  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
267 aa  135  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
267 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
258 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.84 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.47 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.46 
 
 
267 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
267 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
237 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 
237 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  39.36 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  36.61 
 
 
245 aa  115  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34.15 
 
 
255 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  33.47 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  34.27 
 
 
246 aa  108  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
242 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
245 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
254 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
254 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  33.73 
 
 
246 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
233 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.888825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
246 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
241 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
245 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.19 
 
 
256 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 
249 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
249 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  34.87 
 
 
251 aa  102  7e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
264 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
263 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  35.2 
 
 
257 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  33.72 
 
 
245 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  35.2 
 
 
257 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.14 
 
 
250 aa  101  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  35.2 
 
 
257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
246 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  33.98 
 
 
245 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.13 
 
 
246 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
233 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  35.6 
 
 
257 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
263 aa  99.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.131305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>