More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2894 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  100 
 
 
276 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  78.75 
 
 
272 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  78.39 
 
 
272 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  58.09 
 
 
272 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  58.46 
 
 
272 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  59.45 
 
 
267 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  59.36 
 
 
266 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  57.54 
 
 
277 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
290 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
273 aa  235  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.24 
 
 
255 aa  214  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.78 
 
 
255 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
264 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
273 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  48.83 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 
266 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 
257 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  44.67 
 
 
258 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  46.34 
 
 
286 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  43.03 
 
 
263 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0521  hypothetical protein  48.73 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0329  hypothetical protein  48.73 
 
 
293 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0342  hypothetical protein  48.73 
 
 
293 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00283447  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  39.83 
 
 
264 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  43.57 
 
 
250 aa  168  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
268 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0292  hypothetical protein  48.31 
 
 
318 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.04 
 
 
256 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
255 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3383  hypothetical protein  49.15 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000331188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
255 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2037  hypothetical protein  49.15 
 
 
293 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  41.27 
 
 
257 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2247  hypothetical protein  49.15 
 
 
293 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3056  hypothetical protein  49.15 
 
 
298 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.741857  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.25 
 
 
254 aa  158  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  37.34 
 
 
251 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
256 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 
331 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
258 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  34.4 
 
 
259 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  38.89 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
247 aa  145  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
254 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
264 aa  142  5e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.69 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.29 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6327  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.29 
 
 
267 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.34 
 
 
247 aa  135  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
248 aa  133  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
253 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 
267 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
267 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.13 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2888  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1710  Dehydrogenase-like protein  41.11 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
245 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  37.8 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  36.73 
 
 
245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
246 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.43 
 
 
258 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.73 
 
 
261 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
261 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
254 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.16 
 
 
241 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
250 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  31.71 
 
 
249 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.49 
 
 
247 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
246 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185736  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  35.04 
 
 
245 aa  102  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  31.25 
 
 
268 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  29.76 
 
 
261 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  35.04 
 
 
245 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>