More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0195 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  76.99 
 
 
231 aa  357  7e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0966  hypothetical protein  40 
 
 
211 aa  135  7.000000000000001e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.392762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
256 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
256 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  30.09 
 
 
263 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  36.7 
 
 
255 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  32.87 
 
 
256 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  30.27 
 
 
250 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
254 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
254 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  30.58 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  32.41 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 
286 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  31.6 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 
254 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30 
 
 
251 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  32.8 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  32.6 
 
 
261 aa  109  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
241 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  30.52 
 
 
246 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
246 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  36.11 
 
 
264 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.16 
 
 
246 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  33.52 
 
 
246 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  28.85 
 
 
252 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
242 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  29.81 
 
 
245 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.07 
 
 
258 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
251 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
273 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
331 aa  101  8e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
258 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  33.16 
 
 
266 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.22 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.72 
 
 
258 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
253 aa  98.6  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  34.05 
 
 
245 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  34.05 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
267 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
262 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.41 
 
 
263 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.9 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  27.66 
 
 
272 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
277 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  30.74 
 
 
257 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.18 
 
 
252 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  28.19 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  29.39 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.46 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
267 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 
267 aa  89  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
255 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  28.26 
 
 
267 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.38 
 
 
267 aa  88.6  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
254 aa  88.2  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
267 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
245 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.39 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 
272 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0174  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.49 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.76 
 
 
254 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.61 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  28.77 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 
254 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  29.95 
 
 
259 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.61 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
264 aa  85.9  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.78 
 
 
251 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  29.6 
 
 
257 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.23 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.65 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.88 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0473977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>