More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0966 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0966  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  428  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.392762  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
231 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0132  putative dehydrogenase with different specificities (related to short-chain alcohol dehydrogenase)  39.57 
 
 
231 aa  125  6e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 
256 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
251 aa  90.1  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
331 aa  90.1  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
264 aa  88.2  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  28.97 
 
 
264 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
246 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  27.18 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.67 
 
 
246 aa  87.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  31.32 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2677  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.87 
 
 
258 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.457624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 
255 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  29.53 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  34.76 
 
 
252 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  28.31 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  29.9 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  29 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
241 aa  81.3  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  27.49 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  29.9 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  28.8 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  30.11 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  30.81 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
267 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  29.8 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  28.83 
 
 
246 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  25.73 
 
 
258 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  29.32 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  27.96 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.74 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  30.48 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.59 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.51 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
267 aa  72  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  26.11 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  25.73 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  25.73 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
255 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  26.9 
 
 
257 aa  68.2  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  24.51 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.48 
 
 
247 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  26.84 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.49 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.42 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.17 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.71 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  26.13 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31135  Granaticin polyketide synthase putative ketoacyl reductase 2  27.83 
 
 
250 aa  65.9  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.65 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.4 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  26.7 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  25.14 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06918  conserved hypothetical protein  25.95 
 
 
247 aa  64.3  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 
253 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  26.23 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  26.23 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  26.7 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
256 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226851  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.08 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.56 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  24.04 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.04 
 
 
288 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1877  short chain dehydrogenase  23.5 
 
 
263 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  26.18 
 
 
257 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>