More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2906 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.52 
 
 		 258 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  52.24 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  50.61 
 
 		 255 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  48.57 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  49.39 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 		 254 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  49.17 
 
 		 268 aa  224  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  46.44 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  51.01 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.98 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  47.08 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  46.69 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  44.53 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  44.14 
 
 		 257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  43.31 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  44.31 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 277 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 		 286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 		 247 aa  178  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  41.94 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.7 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 261 aa  158  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  40.8 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 272 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.981045  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 237 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  35.25 
 
 		 249 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  35.63 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.41 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.52 
 
 		 267 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  34.98 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.14 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 250 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.82 
 
 		 261 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  34.12 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  33.2 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  34.52 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0528215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  34.4 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 250 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 		 252 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3133  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.95 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1369  pteridine reductase  30.8 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000175176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  32.64 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1614  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0547221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0995  pteridine reductase  30.08 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0277156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5877  short chain fatty acid oxidoreductase  34.02 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.395109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>