More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2912 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2912  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.07408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  58.87 
 
 		 268 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  47.37 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.44 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  48.55 
 
 		 256 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4344  short chain dehydrogenase  50.84 
 
 		 250 aa  228  8e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0643  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.435519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2521  short chain dehydrogenase  48.39 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 		 264 aa  215  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.501804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2858  short chain dehydrogenase  49.59 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.301146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  45.9 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1075  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2736  short chain dehydrogenase  48.78 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.654094  normal  0.0783581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3920  short chain dehydrogenase  51.01 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2311  short chain dehydrogenase  48.99 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0239566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 		 258 aa  209  5e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0415559 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  45.49 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  45.08 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0783  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36858  normal  0.0521945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 		 247 aa  189  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0225  short chain dehydrogenase  42.39 
 
 		 277 aa  175  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0049  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 272 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0046  short chain dehydrogenase  42.74 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0156  short chain dehydrogenase  42.28 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0182  short chain dehydrogenase  41.32 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.648056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000861363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1649  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 		 254 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1250  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 255 aa  162  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1995  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0976  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.541973  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0473977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3732  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00386128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2894  short chain dehydrogenase  40.41 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0656517 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0204  short chain dehydrogenase  39.52 
 
 		 272 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0552  putative oxidoreductase protein  40.91 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.404038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.443115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 248 aa  142  8e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.175608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0259595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  35.83 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 241 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  34.02 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.538738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 258 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.324662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1479  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1548  pteridine reductase 1  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  35.1 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0063  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.233488  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1195  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.350594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0052  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  38.59 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  36.63 
 
 		 251 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  38.59 
 
 		 245 aa  118  9e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0050  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.27 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0548217  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214741  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  34.44 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.85 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3963  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.680971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 248 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2931  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 256 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>