More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0378 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4223  short chain dehydrogenase/reductase family protein  56.96 
 
 		 237 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0048  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1021  short chain dehydrogenase  33.91 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2118  Dihydrofolate reductase  31.22 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0892  short chain dehydrogenase  30.9 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0827  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000371771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3288  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1183  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.03 
 
 		 236 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19640  short chain dehydrogenase  31.9 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2270  short chain dehydrogenase  31.91 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0611  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0577388  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1846  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0845615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1691  short chain dehydrogenase  31.03 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3683  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0616  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10270  short chain dehydrogenase  30.86 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3807  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0169066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3337  short chain dehydrogenase  29.71 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0772  short chain dehydrogenase  30.13 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3217  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 		 239 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00454323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3625  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2775  pteridine reductase  30.77 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3507  short chain dehydrogenase  29.29 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.430968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2921  pteridine reductase  31.3 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3161  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2589  short chain dehydrogenase  29.31 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01575  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2037  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00181892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1592  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0574635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2577  short chain dehydrogenase  29.79 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1681  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.290882  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1793  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0661152  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2317  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.186144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1815  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00999645  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01565  hypothetical protein  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.740406  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2024  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4632  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0587  short chain dehydrogenase  28.45 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.426606  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4493  short chain dehydrogenase  30.93 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0696  pteridine reductase  30.71 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.454716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  31.43 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3430  pteridine reductase  32.24 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.425485  decreased coverage  0.00917749 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2986  pteridine reductase  33.06 
 
 		 251 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4617  short chain dehydrogenase  30.51 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1865  short chain dehydrogenase  28.76 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02487  pteridine reductase  31.75 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00032435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0808  short chain dehydrogenase  29.36 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.230501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0336  pteridine reductase  29.13 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1087  short chain dehydrogenase  28.74 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.717683  hitchhiker  0.0000440763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0328  pteridine reductase  30.49 
 
 		 252 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2701  pteridine reductase  28.69 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.685419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 367 aa  98.6  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0800  pteridine reductase  30.45 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04308  pteridine reductase  30.86 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0711  pteridine reductase  28.4 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1974  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 256 aa  95.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0129  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.4 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.933318  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.67622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1233  short chain dehydrogenase  30.52 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320103  hitchhiker  0.0000168053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.605305  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0985311  hitchhiker  0.000033531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2218  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 		 268 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.43112  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00674  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 194 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284307  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.98 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0742579  normal  0.257249 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0691  short chain dehydrogenase  30.33 
 
 		 331 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.57593  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  28.11 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_004310  BR0700  short chain dehydrogenase  29.8 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  0.0259189 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4319  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1559  dehydrogenase  30.62 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.639568  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.87 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2588  short chain dehydrogenase  30.61 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.12 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0726  pteridine reductase  28.63 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.129082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.28 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>