More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7135 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.35 
 
 
169 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
247 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 
244 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.78 
 
 
244 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.15 
 
 
261 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
255 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.76 
 
 
239 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.31 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
250 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
250 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
276 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
251 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
250 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
253 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.46 
 
 
247 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
249 aa  158  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
249 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
257 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
257 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.34 
 
 
249 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
258 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
246 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.08 
 
 
252 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
252 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
238 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
260 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
250 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
244 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
244 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
259 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  40.8 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
267 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
251 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
263 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
254 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.293604  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
250 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
253 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
252 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
249 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
258 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
251 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.7 
 
 
247 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
279 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
262 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.58 
 
 
255 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
254 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
261 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
265 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
263 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  39.2 
 
 
254 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
252 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0549  putative short-chain type dehydrogenase/reductase  41.22 
 
 
248 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.613292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.82 
 
 
254 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.37 
 
 
252 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  42.52 
 
 
251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  38.8 
 
 
257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  39.76 
 
 
261 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
249 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
249 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
265 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
246 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5749  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 
257 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0613473  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  41.6 
 
 
248 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  39.68 
 
 
255 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40.47 
 
 
253 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
249 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  39.68 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
252 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
254 aa  145  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
248 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  41.37 
 
 
251 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
257 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
256 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
245 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
251 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
257 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
258 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>