More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
261 aa  501  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.95 
 
 
244 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
254 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 
271 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
247 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
239 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
239 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
239 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
239 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
255 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 
251 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
258 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
238 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.55 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
244 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
244 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
255 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4043  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
254 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0597888  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
245 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 
249 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
246 aa  131  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
245 aa  130  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
249 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
257 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
249 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
256 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
262 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
263 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  35 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
169 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
254 aa  126  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
249 aa  126  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
247 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0185042  normal  0.0937687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
251 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
251 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
253 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
259 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 
238 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  37.89 
 
 
248 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
246 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
252 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3469  putative short-chain dehydrogenase  39.31 
 
 
252 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  39.45 
 
 
257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 
246 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
245 aa  124  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  39.45 
 
 
257 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1600  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
248 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  33.73 
 
 
257 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
248 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  37.89 
 
 
248 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
257 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
254 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
255 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
255 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
254 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
243 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  33.46 
 
 
269 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7235  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
263 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.126511 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
246 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
265 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  39.45 
 
 
257 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
249 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  39.06 
 
 
257 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  38.43 
 
 
260 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
256 aa  123  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
246 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
254 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  37.84 
 
 
251 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
248 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0163014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  36.9 
 
 
259 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
261 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32 
 
 
246 aa  122  7e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2727  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
252 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.932234  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
254 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>