More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3622 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  508  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.36 
 
 
262 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
268 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  51.31 
 
 
262 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
268 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.27 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  48.28 
 
 
260 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
267 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
264 aa  185  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.42 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
262 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
262 aa  180  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.54 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
260 aa  176  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  41.64 
 
 
260 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
261 aa  162  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  42.8 
 
 
261 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
259 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
264 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
262 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  43.28 
 
 
259 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.16 
 
 
247 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
264 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
264 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
258 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
264 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  39.41 
 
 
259 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  39.39 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
259 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
259 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
259 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
265 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
263 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
259 aa  144  1e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
256 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
267 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
250 aa  143  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
263 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 
258 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
259 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
259 aa  143  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
256 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  38.66 
 
 
264 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
261 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
256 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.74 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
256 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
261 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
247 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  38.72 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.5 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4563  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
250 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.332785  normal  0.123242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  40.82 
 
 
259 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.46 
 
 
247 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
263 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
250 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13266  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.51 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
261 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
254 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
253 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.38 
 
 
245 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
260 aa  137  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83567  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2297  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.22 
 
 
248 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.0078554  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  35.61 
 
 
254 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  34.38 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  32.84 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
264 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.126254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.83 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.83 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.86 
 
 
268 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.49 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1694  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.83 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.622858  normal  0.939609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.09 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  39.77 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3169  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.83 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
263 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
261 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.34 
 
 
261 aa  133  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>