More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2423 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 262 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  50.76 
 
 		 262 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.76 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.15 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  45.35 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 		 268 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.25 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 		 261 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  37.78 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 		 264 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 262 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  36.94 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  43.09 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0013  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  35.63 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0010  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  35.63 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  37 
 
 		 262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1487  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  36.26 
 
 		 252 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.750194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  32.45 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10840  putative dehydrogenase  34.83 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000391035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 		 294 aa  107  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3076  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.82 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3418  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  35.91 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000786662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2722  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  37.84 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.932867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0466  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.34924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.870685  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.16 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.34 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0563  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  33.33 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2321  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0737567  normal  0.413876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0782028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3188  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.25 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.7 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3440  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.25 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3420  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.25 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.678216  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 		 275 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.36 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3169  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.25 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000352781  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 288 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449608  normal  0.117901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>