More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5052 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 261 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 		 262 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.62 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.74 
 
 		 261 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  48.31 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  45.59 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  43.51 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  40.68 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  38.87 
 
 		 259 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  39.46 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 		 262 aa  148  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  38.66 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  40.08 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.24 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  41.13 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 263 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.73 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.54 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.35 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  41.57 
 
 		 258 aa  135  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.11 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 286 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  38.28 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  35.91 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.59 
 
 		 306 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 		 250 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.35 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 		 246 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.52 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 262 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363126  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  36.74 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.21 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.1 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>