More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1531 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
268 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  73.41 
 
 
268 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  74.25 
 
 
268 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
267 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.64 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.84 
 
 
262 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
260 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  46.99 
 
 
262 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.32 
 
 
262 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
262 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
262 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  46.01 
 
 
260 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
264 aa  162  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
261 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
264 aa  158  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
261 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  41.51 
 
 
261 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
261 aa  152  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  40 
 
 
260 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
261 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
264 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
262 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  35.07 
 
 
260 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
262 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
259 aa  136  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  35.19 
 
 
259 aa  135  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  37.27 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
265 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
253 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161371  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.81 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  35.56 
 
 
264 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
267 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
256 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  34.59 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
261 aa  125  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.96 
 
 
259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.96 
 
 
259 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
256 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
264 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.88 
 
 
256 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
262 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0252898  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.08 
 
 
246 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
263 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
264 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
264 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10945  short chain dehydrogenase  37.69 
 
 
263 aa  124  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
262 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  36.04 
 
 
264 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.785349  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
247 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  32.47 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
251 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
246 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 
294 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.71 
 
 
245 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1623  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.7 
 
 
244 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000163996  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  35.06 
 
 
255 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
254 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.83 
 
 
246 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
250 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
269 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 
268 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
262 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363126  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.56 
 
 
266 aa  122  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.974628  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
254 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32130  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  40.96 
 
 
253 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
253 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3549  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  33.33 
 
 
248 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1825  short chain dehydrogenase  38.06 
 
 
263 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
260 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.59 
 
 
259 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
244 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>