More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5339 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  99.24 
 
 		 264 aa  510  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  84.85 
 
 		 264 aa  441  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  78.63 
 
 		 264 aa  391  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  51.22 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  41.63 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  43.41 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  40.77 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  35.55 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  35.8 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.4 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  37.31 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.55 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 254 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.6 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.41 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0711669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.43 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1067  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.8 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71076  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.78 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  33.97 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 		 244 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000600536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.25 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.29 
 
 		 254 aa  125  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.35981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 256 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.69 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000004002  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1409  aldose dehydrogenase  32.94 
 
 		 258 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.347308 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 		 254 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  34.41 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1874  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.14 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00756891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  31.8 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.51 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.66 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.66 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>