More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0130 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
263 aa  543  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0116  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  90.67 
 
 
268 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0113  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  90.3 
 
 
268 aa  498  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  81.35 
 
 
256 aa  428  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.87 
 
 
251 aa  383  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.54 
 
 
251 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.347308 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.33 
 
 
251 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  decreased coverage  0.00119468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.88 
 
 
262 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0621  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.5 
 
 
263 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.167858  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1204  Short-chain dehydrogenase/reductase  70.43 
 
 
258 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2462  short-chain dehydrogenase  69.72 
 
 
251 aa  363  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1388  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.8 
 
 
258 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.66 
 
 
264 aa  363  2e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145907  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.73 
 
 
249 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449608  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.83 
 
 
240 aa  359  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0328303  normal  0.0791888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.23 
 
 
250 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.307403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.23 
 
 
250 aa  359  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.61 
 
 
239 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0325  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  68.16 
 
 
243 aa  350  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.14 
 
 
243 aa  348  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 
243 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0711669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.62 
 
 
243 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1067  Short-chain alcohol dehydrogenase  66.39 
 
 
258 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71076  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.45 
 
 
273 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5888  putative short-chain dehydrogenase  65.31 
 
 
245 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.45 
 
 
306 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.487588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5935  FixR protein  62.79 
 
 
282 aa  329  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.415665  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68040  putative short-chain dehydrogenase  65.31 
 
 
245 aa  328  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.915385  normal  0.0126935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.7 
 
 
265 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3821  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.27 
 
 
244 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00400497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0956  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.63 
 
 
290 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.23 
 
 
312 aa  322  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4082  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  63.27 
 
 
244 aa  321  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858342  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 
244 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0960196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
244 aa  315  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
244 aa  314  9e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.76 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
260 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 
266 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2285  acetoacetyl-CoA reductase  35.16 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00853533 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
264 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.78 
 
 
250 aa  125  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
262 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0334  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
268 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1622  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.77 
 
 
256 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.598933  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
264 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
278 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
264 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
262 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
251 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  33.83 
 
 
264 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
240 aa  122  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0723888  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3752  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1318  glucose-1-dehydrogenase  35.16 
 
 
248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573048  normal  0.212962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
264 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10130  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
238 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000206354  normal  0.858478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
274 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
516 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  35.16 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0050  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3149  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  30.35 
 
 
248 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0339  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
265 aa  119  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2504  glucose-1-dehydrogenase  34.9 
 
 
248 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0324854 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
256 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
249 aa  118  9e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.13 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
244 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.31 
 
 
257 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1663  glucose-1-dehydrogenase  33.46 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523612  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.819971  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1284  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.98 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.183563 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2313  glucose-1-dehydrogenase  33.72 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2298  glucose-1-dehydrogenase  33.08 
 
 
253 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2275  glucose-1-dehydrogenase  33.46 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
240 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3804  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0396  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2191  glucose-1-dehydrogenase  34.5 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1665  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.72 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139434  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.66 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  32.2 
 
 
255 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>