More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0943 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  100 
 
 
264 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  78.63 
 
 
264 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  78.63 
 
 
264 aa  407  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  80.15 
 
 
264 aa  407  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  78.24 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  49.8 
 
 
258 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 
259 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
262 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  42.63 
 
 
261 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  40.94 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  42.13 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
264 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
264 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
259 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  42.69 
 
 
259 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
259 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
259 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
260 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
261 aa  155  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  43.08 
 
 
259 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
259 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
259 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 
260 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  40.55 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  40.23 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  39.44 
 
 
260 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  38.19 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  37.73 
 
 
255 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  40.47 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.54 
 
 
261 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  42.64 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.54 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
253 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
259 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
258 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  129  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000004002  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
254 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000535211  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000159991  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.69 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.72 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
263 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1587  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00000600536  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
256 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
250 aa  125  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.72 
 
 
254 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.493611  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.46 
 
 
248 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
259 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.87 
 
 
248 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.87 
 
 
248 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
244 aa  124  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.87 
 
 
248 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
256 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
248 aa  124  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.32 
 
 
245 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2226  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
261 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121072  hitchhiker  0.00000459382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
248 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2808  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.18 
 
 
244 aa  123  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000227771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
267 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
259 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.13 
 
 
245 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 
251 aa  122  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
249 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2503  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
244 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000690955  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.97 
 
 
268 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
247 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.46 
 
 
245 aa  122  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
261 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 
268 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.52 
 
 
256 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.262642  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  32.27 
 
 
251 aa  122  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
250 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
262 aa  121  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
261 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14920  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 
247 aa  122  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
245 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>