More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1326 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  518  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  69.47 
 
 
262 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.3 
 
 
260 aa  280  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.52 
 
 
262 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 
268 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.43 
 
 
262 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.76 
 
 
262 aa  237  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.76 
 
 
268 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.62 
 
 
262 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 
268 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.47 
 
 
255 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  49.22 
 
 
260 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
267 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.5 
 
 
261 aa  204  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
261 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
262 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
264 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
264 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
260 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
260 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 
259 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  37.83 
 
 
259 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
259 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
264 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 
259 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
264 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
262 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  36.88 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 
259 aa  138  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.27 
 
 
262 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  36.43 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
294 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
261 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  32.71 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.97 
 
 
247 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  40.31 
 
 
258 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 
259 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
259 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
259 aa  124  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
264 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.221391  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
260 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
259 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
260 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
263 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
256 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.67 
 
 
249 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
250 aa  123  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
256 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
256 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
249 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 
247 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
259 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
258 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1841  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  36.57 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.08 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
362 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.29 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  34.81 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  34.75 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  34.75 
 
 
252 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  32.45 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.11 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  31.41 
 
 
268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.93 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.22 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
263 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.63 
 
 
250 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
253 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
268 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  34.69 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0466  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  34.35 
 
 
255 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.34924  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
249 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1246  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.6 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>