More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1623 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.25 
 
 
260 aa  395  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.05 
 
 
261 aa  352  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.73 
 
 
262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.34 
 
 
262 aa  320  9.999999999999999e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.92 
 
 
261 aa  306  2.0000000000000002e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
262 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
267 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
261 aa  191  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
261 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
262 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0734499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
263 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1821  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 
264 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.174023  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
261 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
262 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 
259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
260 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
263 aa  168  9e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
260 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
261 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
271 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
260 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.389039  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
262 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
260 aa  157  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 
263 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
255 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
277 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
263 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
260 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1391  NAD/NADP dependent oxidoreductase  35.88 
 
 
261 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
253 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
262 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
294 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
259 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 
278 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
259 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2186  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  41 
 
 
263 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.158551  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 
259 aa  148  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
258 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
259 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
259 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
265 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2540  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.88 
 
 
258 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
262 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163833  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
259 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
258 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.567568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
261 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
258 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.298877  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
260 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.482868  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
259 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
263 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
325 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.52 
 
 
259 aa  140  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
264 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
237 aa  140  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
265 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  33.71 
 
 
268 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
264 aa  139  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.84 
 
 
259 aa  138  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
259 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0406347 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  32.34 
 
 
264 aa  137  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
263 aa  138  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
268 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  37.69 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
265 aa  135  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>