More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5555 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
262 aa  518  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.32 
 
 
260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 
262 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.52 
 
 
261 aa  248  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
259 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.28 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.89 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.4 
 
 
255 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 
268 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.78 
 
 
262 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 
268 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  40.08 
 
 
260 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
262 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
261 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
264 aa  142  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
264 aa  136  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
261 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  38.11 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
259 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  36.09 
 
 
260 aa  126  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
261 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
264 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  36.64 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.96 
 
 
306 aa  117  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
259 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  35.41 
 
 
264 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
247 aa  115  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
294 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  39.41 
 
 
297 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
259 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
256 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
249 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  31.06 
 
 
254 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
252 aa  111  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.09 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.01 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  35.06 
 
 
263 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  36.57 
 
 
259 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
264 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
284 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
284 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459641  normal  0.940814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2157  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166791  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
247 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
284 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  33.82 
 
 
262 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 
250 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13266  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
262 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
267 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.964929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
261 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
255 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
278 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
255 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
254 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
251 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
255 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
260 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
255 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
255 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
253 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.851754  normal  0.710684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  34.92 
 
 
259 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
286 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
256 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
262 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0252898  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1051  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.48 
 
 
245 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305162  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
254 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
259 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
262 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
246 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
263 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
262 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363126  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
264 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0734919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>