More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3849 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  100 
 
 
260 aa  523  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  81.92 
 
 
264 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  70.77 
 
 
261 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.54 
 
 
262 aa  378  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.71 
 
 
264 aa  295  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
264 aa  288  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  53.46 
 
 
261 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  54.44 
 
 
260 aa  271  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  51.54 
 
 
260 aa  265  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 
259 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 
259 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  51.38 
 
 
259 aa  254  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  51.35 
 
 
260 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  50 
 
 
259 aa  246  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  50.97 
 
 
262 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  51.71 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  49.61 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
259 aa  230  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
259 aa  230  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  50 
 
 
259 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  49.61 
 
 
259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 
259 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  48.25 
 
 
258 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
262 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
262 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  37.04 
 
 
268 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  36 
 
 
268 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
264 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
264 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 
258 aa  151  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
261 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
259 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
262 aa  145  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
263 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
268 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
264 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
249 aa  143  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
294 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
261 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.87 
 
 
268 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
265 aa  142  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 
267 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  36.72 
 
 
260 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.33 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72880  putative short-chain dehydrogenase  34.85 
 
 
260 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  34.72 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.82 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  35.66 
 
 
248 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.88 
 
 
246 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1835  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.12 
 
 
247 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0909527  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
254 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
248 aa  136  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
254 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  32.95 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5566  acetoacetyl-CoA reductase  33.98 
 
 
248 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431609  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  33.08 
 
 
252 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6325  putative short-chain dehydrogenase  34.21 
 
 
260 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1924  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00155305  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  35 
 
 
248 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  35.16 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0166  acetoacetyl-CoA reductase  32.56 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1549  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.88 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.755021  normal  0.0732126 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1014  acetoacetyl-CoA reductase  32.56 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0193  acetoacetyl-CoA reductase  32.56 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0167  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000024572  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1337  acetoacetyl-CoA reductase  32.56 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  32.95 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
248 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.82 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  34.63 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
249 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0948  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.91 
 
 
249 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000118605  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 
245 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.82 
 
 
245 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  35.27 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
251 aa  132  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3090  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.27 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.22 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.23 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  34.34 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.974628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.96 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0830  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.48 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>