More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0368 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0368  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4577  short chain dehydrogenase  76.45 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.795837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.13 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2029  short chain dehydrogenase  75.97 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.13 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.787894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0740  short chain dehydrogenase  75.97 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0279  short chain dehydrogenase  68.9 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946845  normal  0.64471 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4368  short chain dehydrogenase  67.95 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.494566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3998  short chain dehydrogenase  67.95 
 
 		 259 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.219529  normal  0.855518 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6404  short chain dehydrogenase  69.5 
 
 		 259 aa  345  5e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.327689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5172  short chain dehydrogenase  69.11 
 
 		 259 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3525  short chain dehydrogenase  67.18 
 
 		 259 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  64.23 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3349  short chain dehydrogenase  63.32 
 
 		 260 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0339  short chain dehydrogenase  64.5 
 
 		 263 aa  318  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4387  short chain dehydrogenase  64.23 
 
 		 260 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  58.69 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  51.36 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 		 262 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2733  short chain dehydrogenase  53.36 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  49.41 
 
 		 264 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 		 264 aa  228  9e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4622  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5339  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.146559  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5428  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.819965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5718  short chain dehydrogenase  41.47 
 
 		 264 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5918  short chain dehydrogenase  40.16 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0943  short chain dehydrogenase  40.62 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 		 176 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2190  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 		 258 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  35.85 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  36.19 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 268 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.60133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4081  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104801  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.27 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31260  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  32.71 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.974628  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 237 aa  118  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2001  putative short-chain alcohol dehydrogenase  35.23 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.354016 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  31.56 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.71 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  31.01 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 259 aa  112  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0252898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 		 259 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.58 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1817  short chain dehydrogenase  31.01 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.628756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1699  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.56 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.2 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6325  putative short-chain dehydrogenase  34.69 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  30.23 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2412  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  30.56 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0461  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  32.42 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.230062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 		 252 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.71453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  31.01 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2878  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.240803  normal  0.0339025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.44 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>