More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
303 aa  613  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.17 
 
 
297 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  63.67 
 
 
307 aa  365  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  62.63 
 
 
297 aa  365  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 
292 aa  362  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.28 
 
 
309 aa  362  6e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.81 
 
 
306 aa  359  4e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.55 
 
 
333 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.21 
 
 
335 aa  342  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.75 
 
 
334 aa  330  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
333 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.4 
 
 
297 aa  329  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  57.54 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  57.54 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  57.54 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  57.54 
 
 
294 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  57.54 
 
 
294 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0067  Short-chain alcohol dehydrogenase  56.49 
 
 
296 aa  326  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  56.49 
 
 
298 aa  325  7e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.09 
 
 
299 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
335 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.44 
 
 
294 aa  319  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  55.44 
 
 
294 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  55.79 
 
 
294 aa  318  6e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  55.44 
 
 
294 aa  318  6e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  55.44 
 
 
294 aa  318  6e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  55.44 
 
 
294 aa  318  6e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  55.44 
 
 
294 aa  318  6e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.06 
 
 
339 aa  316  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  55.09 
 
 
294 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.71 
 
 
340 aa  315  7e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.14 
 
 
299 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3897  oxidoreductase NAD(P)-binding subunit  55.52 
 
 
294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  54.74 
 
 
328 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.74 
 
 
328 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.39 
 
 
337 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
293 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
298 aa  300  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 
293 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 
293 aa  295  8e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.22 
 
 
293 aa  294  1e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.51 
 
 
308 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.54 
 
 
298 aa  294  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
300 aa  291  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.68 
 
 
304 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 
297 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
301 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.6 
 
 
285 aa  287  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0858  Short-chain alcohol dehydrogenase  53.28 
 
 
289 aa  285  4e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 
286 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
272 aa  281  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.52 
 
 
292 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.78 
 
 
285 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
285 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  52.16 
 
 
285 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
285 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.4 
 
 
298 aa  275  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 
286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.89 
 
 
285 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
285 aa  271  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
285 aa  269  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.65 
 
 
286 aa  269  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  52.17 
 
 
288 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.27 
 
 
285 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
286 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
286 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.12 
 
 
285 aa  265  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.47 
 
 
286 aa  265  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
285 aa  265  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 
285 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.19 
 
 
285 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
285 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.73 
 
 
288 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
285 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
306 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
295 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  51.08 
 
 
313 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
295 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.72 
 
 
295 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.83 
 
 
288 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.03 
 
 
296 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.63 
 
 
286 aa  258  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
292 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
284 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.92 
 
 
293 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.26 
 
 
311 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
301 aa  257  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.03 
 
 
284 aa  255  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.13 
 
 
288 aa  255  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
285 aa  255  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
288 aa  254  9e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.81 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  50 
 
 
337 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.55 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
296 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.23 
 
 
287 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.55 
 
 
285 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>