More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1402 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  570  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15410  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  65.6 
 
 
313 aa  358  8e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.54 
 
 
286 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.066838  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.31 
 
 
308 aa  328  8e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.65 
 
 
304 aa  322  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.57 
 
 
297 aa  321  8e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.57 
 
 
297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17140  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.57 
 
 
307 aa  317  2e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391545  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.95 
 
 
293 aa  315  5e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.8 
 
 
297 aa  314  9.999999999999999e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.62 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.29 
 
 
298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
337 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  56.79 
 
 
328 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
328 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.18 
 
 
333 aa  309  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752467  normal  0.0103168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19840  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  58.51 
 
 
297 aa  308  9e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 
292 aa  306  3e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35800  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.19 
 
 
285 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.19 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
333 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.828162  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
288 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.09 
 
 
298 aa  299  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  55.09 
 
 
288 aa  299  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
285 aa  299  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
285 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
285 aa  297  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.52 
 
 
285 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.12 
 
 
335 aa  297  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 
299 aa  297  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
335 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  55.2 
 
 
306 aa  295  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
293 aa  294  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.34 
 
 
298 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 
285 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.62 
 
 
339 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0067  Short-chain alcohol dehydrogenase  52.33 
 
 
296 aa  293  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 
295 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3415  oxidoreductase  53.96 
 
 
298 aa  292  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
334 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3405  oxidoreductase  53.76 
 
 
294 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3411  oxidoreductase  53.76 
 
 
294 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3506  oxidoreductase  53.76 
 
 
294 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3340  oxidoreductase  53.76 
 
 
294 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.461331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3331  oxidoreductase  53.76 
 
 
294 aa  291  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.05 
 
 
294 aa  291  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3472  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0691  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3182  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02878  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3289  oxidoreductase  53.41 
 
 
294 aa  291  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3432  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4315  oxidoreductase  53.05 
 
 
294 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
295 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.67 
 
 
285 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.638488  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
286 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.21 
 
 
292 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.23 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  53.17 
 
 
285 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06640  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  53.52 
 
 
309 aa  286  4e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 
295 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.23 
 
 
285 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 
288 aa  285  7e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.58 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.22 
 
 
335 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05560  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.35 
 
 
303 aa  281  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.61 
 
 
280 aa  280  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.16 
 
 
285 aa  281  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3897  oxidoreductase NAD(P)-binding subunit  54.45 
 
 
294 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.88 
 
 
292 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.93 
 
 
286 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.96 
 
 
340 aa  279  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 
285 aa  279  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.4 
 
 
285 aa  279  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
285 aa  278  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  52.11 
 
 
286 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.84 
 
 
301 aa  277  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 
288 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.76 
 
 
285 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
291 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.791141  normal  0.178884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
285 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.53 
 
 
288 aa  275  7e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0858  Short-chain alcohol dehydrogenase  50.36 
 
 
289 aa  273  3e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
286 aa  271  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.7 
 
 
285 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  47.55 
 
 
288 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
285 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
285 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.94 
 
 
290 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.29 
 
 
293 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.04 
 
 
287 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2859  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
285 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
290 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.424888 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>