More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2740 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5643  short chain dehydrogenase  71.76 
 
 
262 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.73 
 
 
261 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4015  short chain dehydrogenase  67.18 
 
 
259 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.553576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  64.62 
 
 
260 aa  352  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3136  short chain dehydrogenase  54.62 
 
 
258 aa  292  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 
258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4968  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
258 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4118  short chain dehydrogenase  54.55 
 
 
265 aa  281  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3327  short chain dehydrogenase  52.31 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5040  short chain dehydrogenase  52.31 
 
 
258 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.719425  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5244  short chain dehydrogenase  52.69 
 
 
258 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.900169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0642  short chain dehydrogenase  54.05 
 
 
258 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5322  short chain dehydrogenase  55.21 
 
 
258 aa  272  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0623  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 
258 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3598  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
258 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1602  short chain dehydrogenase  53.67 
 
 
258 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1085  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1782  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0820  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
258 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1162  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
258 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0644  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 
280 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2378  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 
280 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  51.35 
 
 
257 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1065  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 
258 aa  242  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
262 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  49.62 
 
 
250 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  44.74 
 
 
262 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
255 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
297 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
285 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.94 
 
 
249 aa  135  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
284 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.01 
 
 
246 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
285 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.33 
 
 
272 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
246 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
244 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
246 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.61 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
251 aa  125  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
246 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
251 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.8 
 
 
296 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
293 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
294 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.432836  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
254 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
255 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  34.13 
 
 
286 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
262 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143414  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
245 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
262 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
287 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
250 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
250 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
252 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
254 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
247 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
255 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
284 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0520  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
262 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
252 aa  123  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
284 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.34 
 
 
266 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.76 
 
 
246 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
251 aa  122  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
246 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3253  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.99 
 
 
250 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152872  normal  0.595682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.61 
 
 
246 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
285 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
285 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
260 aa  121  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  36.19 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
244 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1613  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.02 
 
 
248 aa  120  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
292 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.66 
 
 
247 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  33.73 
 
 
286 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>