More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0535 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  100 
 
 
262 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  96.95 
 
 
262 aa  530  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1065  short chain dehydrogenase  56.2 
 
 
258 aa  276  2e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3136  short chain dehydrogenase  48.65 
 
 
258 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  48.84 
 
 
258 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4968  short chain dehydrogenase  48.84 
 
 
258 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5244  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.900169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3327  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5040  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 
258 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.719425  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0623  short chain dehydrogenase  47.49 
 
 
258 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5643  short chain dehydrogenase  51.15 
 
 
262 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0642  short chain dehydrogenase  45.95 
 
 
258 aa  240  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1782  short chain dehydrogenase  48.26 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1085  short chain dehydrogenase  48.26 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0820  short chain dehydrogenase  48.26 
 
 
258 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0644  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 
280 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2378  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 
280 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1162  short chain dehydrogenase  48.26 
 
 
258 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1602  short chain dehydrogenase  48.06 
 
 
258 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5322  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3598  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4015  short chain dehydrogenase  46.15 
 
 
259 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.553576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  45 
 
 
260 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.02 
 
 
261 aa  225  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  42.75 
 
 
250 aa  224  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  45.42 
 
 
262 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4118  short chain dehydrogenase  41.73 
 
 
265 aa  206  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 
246 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
246 aa  143  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
255 aa  136  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21608  predicted protein  35.12 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.51 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7123  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.33 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.47 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323528  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 
244 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.97 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_002620  TC0508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
248 aa  124  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
253 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.83 
 
 
272 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
239 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 
245 aa  124  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
261 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
261 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 
275 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.388897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
256 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
247 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.25 
 
 
248 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.16 
 
 
250 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
250 aa  121  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.04 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
255 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.65 
 
 
253 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1400  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 
264 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.473326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2889  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.41 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00153058  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
283 aa  118  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08226  putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.55 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.13 
 
 
243 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
251 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  32.56 
 
 
256 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.53 
 
 
249 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.33 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 
269 aa  115  6e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
255 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
284 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  34.52 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3253  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4605  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350123  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.55 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  32.94 
 
 
248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.95 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.73 
 
 
241 aa  113  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
239 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
256 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
282 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>