More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5322 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5322  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3136  short chain dehydrogenase  72.48 
 
 		 258 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1602  short chain dehydrogenase  74.81 
 
 		 258 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0820  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1085  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1162  short chain dehydrogenase  74.03 
 
 		 258 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1782  short chain dehydrogenase  73.64 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  71.21 
 
 		 258 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0644  short chain dehydrogenase  73.26 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2378  short chain dehydrogenase  73.26 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0623  short chain dehydrogenase  69.77 
 
 		 258 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3327  short chain dehydrogenase  69.77 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5244  short chain dehydrogenase  70.16 
 
 		 258 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.900169 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5040  short chain dehydrogenase  69.77 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.719425  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4968  short chain dehydrogenase  70.43 
 
 		 258 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0642  short chain dehydrogenase  67.44 
 
 		 258 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3598  short chain dehydrogenase  69.65 
 
 		 258 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  62.26 
 
 		 257 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.38 
 
 		 261 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  58.08 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5643  short chain dehydrogenase  57.53 
 
 		 262 aa  294  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4015  short chain dehydrogenase  57.92 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.553576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  55.21 
 
 		 262 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  60.31 
 
 		 250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1065  short chain dehydrogenase  56.2 
 
 		 258 aa  279  2e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4118  short chain dehydrogenase  48.46 
 
 		 265 aa  254  8e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  47.88 
 
 		 262 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  38.4 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 		 246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  35.46 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  36.61 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  39.11 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 260 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  33.85 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.08 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.877905  normal  0.0437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.47 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1239  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.12 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.07 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  35.74 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 288 aa  122  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 285 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.42 
 
 		 249 aa  121  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.05 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000362562 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  34.54 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>