More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0877 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0642  short chain dehydrogenase  58.75 
 
 
258 aa  314  9e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3136  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 
258 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0623  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 
258 aa  300  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4968  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 
258 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  58.37 
 
 
258 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5322  short chain dehydrogenase  62.26 
 
 
258 aa  296  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5244  short chain dehydrogenase  57.98 
 
 
258 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.900169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3327  short chain dehydrogenase  57.59 
 
 
258 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5040  short chain dehydrogenase  57.59 
 
 
258 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.719425  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3598  short chain dehydrogenase  58.75 
 
 
258 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0820  short chain dehydrogenase  57.98 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1782  short chain dehydrogenase  57.98 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1085  short chain dehydrogenase  57.98 
 
 
258 aa  285  7e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0644  short chain dehydrogenase  57.59 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2378  short chain dehydrogenase  57.59 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1602  short chain dehydrogenase  57.2 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1162  short chain dehydrogenase  57.59 
 
 
258 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5643  short chain dehydrogenase  55.21 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4015  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 
259 aa  272  3e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.553576  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  59.16 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.83 
 
 
261 aa  268  7e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
260 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  51.35 
 
 
262 aa  256  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1065  short chain dehydrogenase  48.45 
 
 
258 aa  241  9e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4118  short chain dehydrogenase  46.54 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  44.19 
 
 
262 aa  230  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1613  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.8 
 
 
247 aa  129  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0231  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.94 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0563  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
252 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.73 
 
 
239 aa  126  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3534  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  34.78 
 
 
244 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
269 aa  125  9e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
255 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
251 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
249 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
251 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
256 aa  123  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1837  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
247 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000200406  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.06 
 
 
246 aa  122  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
258 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
256 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6360  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 
262 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4572  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  34.38 
 
 
258 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
250 aa  122  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
246 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.66 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  30.71 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.746696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.772329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
248 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.348466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
272 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.32 
 
 
272 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
272 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6012  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.998031 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  36.51 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
264 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
259 aa  118  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.88 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6308  short chain dehydrogenase  37.25 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.367823 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 
243 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7178  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
262 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0959368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
251 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1043  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00108019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.98 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0269  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.82 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5486  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398056  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  35.97 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6772  short chain dehydrogenase  38.31 
 
 
262 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  32.27 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.43 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.117337  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>