More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3598 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3598  short chain dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.61001  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0623  short chain dehydrogenase  87.55 
 
 
258 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4968  short chain dehydrogenase  87.55 
 
 
258 aa  460  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  86.38 
 
 
258 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5244  short chain dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.900169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3327  short chain dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5040  short chain dehydrogenase  85.6 
 
 
258 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.719425  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1602  short chain dehydrogenase  74.32 
 
 
258 aa  384  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1782  short chain dehydrogenase  73.54 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1162  short chain dehydrogenase  73.54 
 
 
258 aa  377  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0820  short chain dehydrogenase  73.54 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1085  short chain dehydrogenase  73.54 
 
 
258 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0644  short chain dehydrogenase  73.15 
 
 
280 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2378  short chain dehydrogenase  73.15 
 
 
280 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.594713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3136  short chain dehydrogenase  69.65 
 
 
258 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5322  short chain dehydrogenase  69.65 
 
 
258 aa  361  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0642  short chain dehydrogenase  64.98 
 
 
258 aa  354  8.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.282572  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  58.75 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.92 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5643  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 
262 aa  295  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.633218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1993  short chain dehydrogenase  55.6 
 
 
260 aa  287  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.750053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2740  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.046244  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4015  short chain dehydrogenase  54.83 
 
 
259 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.553576  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1065  short chain dehydrogenase  52.33 
 
 
258 aa  263  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0617458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4118  short chain dehydrogenase  47.89 
 
 
265 aa  262  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  54.79 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0535  short chain dehydrogenase  47.67 
 
 
262 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1449  short chain dehydrogenase  47.29 
 
 
262 aa  248  7e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2718  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
255 aa  161  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  33.6 
 
 
291 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
285 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
285 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.8 
 
 
249 aa  129  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 
317 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
297 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
263 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
263 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.39 
 
 
255 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
287 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
284 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
265 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
288 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
288 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 
272 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.03 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.26 
 
 
285 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
251 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
249 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.62 
 
 
266 aa  122  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
255 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  39.02 
 
 
258 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
253 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0299033  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.77 
 
 
250 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 
246 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
251 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
247 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.402238  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.13 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
247 aa  118  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
285 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5498  sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase  32.84 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.21 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  34.27 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  34.27 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
258 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
253 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
284 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
255 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>