More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1815 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  100 
 
 
258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.5 
 
 
258 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2324  short chain dehydrogenase  52.31 
 
 
270 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2836  short chain dehydrogenase  50.77 
 
 
269 aa  257  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3912  short chain dehydrogenase  50.57 
 
 
275 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3773  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 
273 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3485  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 
273 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  48.4 
 
 
269 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  48.44 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  48.44 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 
278 aa  238  6.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1563  short chain dehydrogenase  51.74 
 
 
273 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17236 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26200  short chain dehydrogenase  47.83 
 
 
277 aa  237  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1726  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 
265 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937598  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
257 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1425  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.7 
 
 
268 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2588  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.45 
 
 
248 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1365  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.468892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.65 
 
 
248 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22411  predicted protein  35.56 
 
 
321 aa  149  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1458  short chain dehydrogenase  46.93 
 
 
240 aa  146  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
256 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
252 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.26 
 
 
248 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
269 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
251 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 
249 aa  139  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
246 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.99 
 
 
255 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
246 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
251 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
251 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
250 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
252 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
260 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
263 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
246 aa  135  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1085  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.27 
 
 
248 aa  135  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.021981  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3470  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
250 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0741311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
273 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 
262 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
263 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
264 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
252 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
266 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
246 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
263 aa  131  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
263 aa  131  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
263 aa  131  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
263 aa  131  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 
263 aa  131  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.13 
 
 
246 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
246 aa  131  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  35.51 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
259 aa  130  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.73 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.54 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  37.25 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.44 
 
 
249 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
246 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1031  putative short-chain alcohol dehydrogenase  36.5 
 
 
260 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.394755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
257 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  34.68 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  34.24 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
260 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09160  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.14 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>