More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2407 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3773  short chain dehydrogenase  73.26 
 
 
273 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3485  short chain dehydrogenase  73.63 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591182 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1563  short chain dehydrogenase  74.72 
 
 
273 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17236 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2836  short chain dehydrogenase  72.52 
 
 
269 aa  394  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2324  short chain dehydrogenase  71.05 
 
 
270 aa  388  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3912  short chain dehydrogenase  68.91 
 
 
275 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  67.54 
 
 
269 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  66.91 
 
 
269 aa  381  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  67.54 
 
 
269 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1726  short chain dehydrogenase  61.57 
 
 
265 aa  318  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26200  short chain dehydrogenase  54.44 
 
 
277 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  50.58 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.58 
 
 
258 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
257 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22411  predicted protein  37.93 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
249 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1425  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.15 
 
 
268 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1365  short chain dehydrogenase  37.15 
 
 
268 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.468892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
252 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
253 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1458  short chain dehydrogenase  44 
 
 
240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 
255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0470  hypothetical protein  34.94 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
244 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.8 
 
 
249 aa  133  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3850  sorbitol dehydrogenase  30.5 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.13 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
250 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0638  sorbitol dehydrogenase  31.01 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.122771  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
258 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.6 
 
 
251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
254 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
254 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  34.48 
 
 
257 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
252 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
252 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0489  sorbitol dehydrogenase  30 
 
 
260 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000937678  hitchhiker  0.00159634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
254 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.11 
 
 
252 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
239 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
252 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
253 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
248 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
246 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.71 
 
 
252 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 
252 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  37.69 
 
 
254 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
256 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3166  sorbitol dehydrogenase  29.5 
 
 
269 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138901  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.9 
 
 
251 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
253 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984455  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
258 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0719  sorbitol dehydrogenase  29.96 
 
 
260 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000035805  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
251 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
239 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
239 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
265 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2735  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
253 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.534255 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.64 
 
 
254 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
248 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
239 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
254 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.03 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3247  sorbitol dehydrogenase  29.18 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0320221  normal  0.626785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
249 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03260  conserved hypothetical protein  35.25 
 
 
554 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0474443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2653  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  31.6 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2683  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
250 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138806  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604698  normal  0.0177772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>