More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1458 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1458  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.816874 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  41.8 
 
 		 258 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2836  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1563  short chain dehydrogenase  40.54 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3773  short chain dehydrogenase  39.08 
 
 		 273 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3485  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.591182 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  38.04 
 
 		 269 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3912  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2324  short chain dehydrogenase  37.21 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  36.86 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26200  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1425  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.34 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1365  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.468892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1726  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22411  predicted protein  32.06 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.61 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  34.16 
 
 		 252 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2920  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.566971  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.71 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 		 265 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.15 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.848972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  31.12 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0778  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.81 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1855  short chain dehydrogenase  40.76 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.555083  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.55 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.34 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4557  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.05 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221009  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  31.08 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.677514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  35.74 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  36.6 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3749  short chain dehydrogenase  35.12 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 269 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  31.08 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8214  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 		 248 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 		 264 aa  101  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314701  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4264  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.2 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  35.74 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.24 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  34.98 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  33.75 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2700  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.657901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  35.74 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5759  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.74 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0470  hypothetical protein  34.98 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 		 249 aa  99.4  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.44826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7371  short-chain alcohol dehydrogenase  36.4 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  35.32 
 
 		 257 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 		 299 aa  98.6  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.92 
 
 		 253 aa  98.6  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 256 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 		 246 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4743  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.6 
 
 		 254 aa  98.2  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 		 249 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>