More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0261 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
285 aa  591  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.46 
 
 
306 aa  406  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.82 
 
 
287 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.41 
 
 
287 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.94 
 
 
288 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.67 
 
 
285 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.69 
 
 
285 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.68 
 
 
284 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.33 
 
 
282 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.97 
 
 
284 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.5 
 
 
293 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.5 
 
 
286 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  59.42 
 
 
288 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.14 
 
 
286 aa  362  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.15 
 
 
296 aa  360  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.82 
 
 
288 aa  358  5e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  58.33 
 
 
288 aa  354  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  58.33 
 
 
288 aa  354  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  58.33 
 
 
288 aa  354  7.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  58.33 
 
 
288 aa  354  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  57.97 
 
 
288 aa  354  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  56.58 
 
 
288 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.01 
 
 
287 aa  353  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 
288 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 
288 aa  352  4e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 
288 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  57.3 
 
 
288 aa  351  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.97 
 
 
282 aa  349  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4895  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 
286 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.317832 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 
286 aa  348  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.82 
 
 
284 aa  348  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 
285 aa  348  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
284 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  57.97 
 
 
286 aa  345  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  57.97 
 
 
286 aa  345  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.97 
 
 
289 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
285 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.85 
 
 
285 aa  338  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.61 
 
 
297 aa  338  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.11 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.48 
 
 
285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.24 
 
 
284 aa  333  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0991  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
291 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123495  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1971  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0942003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1370  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2253  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.36 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  normal  0.0427159 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3020  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3149  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.653242  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1278  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  58.33 
 
 
285 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.93331  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.36 
 
 
285 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.11398  normal  0.546447 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.27 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
291 aa  325  5e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.608035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.76 
 
 
287 aa  323  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
292 aa  322  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.45 
 
 
283 aa  321  7e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2292  short-chain dehydrogenase/reductase, oxidoreductase  54.91 
 
 
291 aa  322  7e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.253121  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2129  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.51 
 
 
289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.71 
 
 
283 aa  318  5e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  54.12 
 
 
292 aa  315  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.76 
 
 
292 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  57.63 
 
 
337 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  56.77 
 
 
334 aa  308  8e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09002  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G03620)  54.71 
 
 
296 aa  304  9.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3899  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.3 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.190456 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  54.78 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 
291 aa  299  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.14 
 
 
305 aa  298  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  55.13 
 
 
337 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
285 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 
286 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
285 aa  295  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
285 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
285 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
288 aa  292  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
293 aa  291  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.73 
 
 
285 aa  290  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
286 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
308 aa  288  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
286 aa  288  6e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.57 
 
 
288 aa  288  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.58 
 
 
292 aa  288  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 
286 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  51.84 
 
 
318 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2677  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  53.73 
 
 
286 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.822958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
285 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.798039  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
284 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.9 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
298 aa  282  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  51.09 
 
 
285 aa  281  6.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
288 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
286 aa  281  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.48 
 
 
286 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  51.82 
 
 
288 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
301 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03679  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G05870)  49.64 
 
 
302 aa  279  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0128592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2723  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.82 
 
 
285 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.612253  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
295 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>