More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0460 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  100 
 
 
291 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  63.44 
 
 
317 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  62.86 
 
 
334 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  59.5 
 
 
318 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1817  short chain dehydrogenase  61.07 
 
 
337 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  59.5 
 
 
337 aa  361  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
301 aa  350  1e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.36 
 
 
368 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.99 
 
 
285 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  54.67 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2428  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.12 
 
 
285 aa  318  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.08 
 
 
287 aa  316  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.71 
 
 
284 aa  315  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
288 aa  314  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36870  putative short-chain dehydrogenase  53.85 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.22798  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
287 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 
288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 
288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 
288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  54.8 
 
 
288 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  54.45 
 
 
288 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
288 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  55.16 
 
 
288 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
288 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.45 
 
 
285 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0775551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
285 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.359984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  53.74 
 
 
288 aa  305  7e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  53.74 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  50.7 
 
 
288 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.14 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136189  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0766  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
285 aa  299  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.566144  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
285 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319892  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  52.31 
 
 
288 aa  299  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.13 
 
 
285 aa  299  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.957314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.67 
 
 
284 aa  298  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0919  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.71 
 
 
285 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
284 aa  298  6e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
285 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539155  normal  0.142405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.93 
 
 
286 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.984934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.26 
 
 
284 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
286 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
289 aa  296  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5467  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.17 
 
 
305 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
285 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716847  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
285 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.110576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.61 
 
 
286 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.06 
 
 
286 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 
297 aa  294  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
285 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.402229  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51.25 
 
 
281 aa  293  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
288 aa  292  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.07 
 
 
286 aa  292  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.82 
 
 
286 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.453828  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
285 aa  292  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
285 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.35 
 
 
282 aa  291  9e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
286 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4750  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.12 
 
 
288 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306467  normal  0.765133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
296 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.530393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.64 
 
 
286 aa  287  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239121  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.74 
 
 
288 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.17 
 
 
284 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.92 
 
 
287 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.09 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1180  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.14 
 
 
293 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0727781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.42 
 
 
298 aa  285  7e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.795136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 
285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2584  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.98 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.01 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2905  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.64 
 
 
292 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 
306 aa  281  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.25 
 
 
288 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.93 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
337 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.47 
 
 
285 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5588  dehydrogenase  48.4 
 
 
285 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2925  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.82 
 
 
296 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4304  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
311 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2411  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.18 
 
 
286 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
328 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.1 
 
 
285 aa  279  5e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
328 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 
285 aa  278  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
295 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0346785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
295 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.546475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.46 
 
 
293 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
300 aa  276  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319997  normal  0.350002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.69 
 
 
283 aa  275  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
297 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.06 
 
 
292 aa  275  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.082877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.18 
 
 
287 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.36 
 
 
298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.907948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
285 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.76 
 
 
339 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.12 
 
 
297 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.3 
 
 
308 aa  271  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>