More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2580 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
244 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19640  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  80.95 
 
 
261 aa  397  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.96 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
271 aa  184  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.3 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
239 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
247 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.28 
 
 
255 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
239 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.04 
 
 
239 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 
239 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0663055  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.71 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.932372  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.539797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 
267 aa  143  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
248 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
261 aa  136  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  34.85 
 
 
249 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
252 aa  134  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13463  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  34.98 
 
 
250 aa  133  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
257 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
249 aa  133  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
251 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
251 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2637  short chain dehydrogenase  38.21 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.880192  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
251 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
243 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
272 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2319  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
247 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
254 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 
248 aa  129  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5146  short chain dehydrogenase  35.22 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.485132 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  36 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00843006  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
250 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.6 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.48 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1408  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.5 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.743298  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
256 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
243 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
262 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
169 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
265 aa  125  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 
248 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
249 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  35.2 
 
 
254 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
242 aa  125  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
254 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
255 aa  125  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.675058  normal  0.0165705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
256 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11020  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767599  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
254 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 
254 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1489  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
249 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129489  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3241  glucose-1-dehydrogenase  38.21 
 
 
248 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
249 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.876035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.69 
 
 
246 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 
266 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 
250 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
245 aa  124  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
253 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 
246 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
255 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 
249 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4745  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
254 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146753  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
249 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
249 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
254 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 
247 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  35.12 
 
 
257 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.19 
 
 
249 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
246 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00235885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
267 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>