More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3583 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2051  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.51 
 
 		 255 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.641389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.65 
 
 		 255 aa  334  7.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.31 
 
 		 255 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5975  NAD/NADP dependent oxidoreductase  63.53 
 
 		 255 aa  304  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.31 
 
 		 255 aa  298  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2755  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.57 
 
 		 259 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.39 
 
 		 259 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535154 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 		 258 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.24 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.23 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.88 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 255 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.46 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.57 
 
 		 247 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 257 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  40.78 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.57 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.51 
 
 		 246 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.64 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.11 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  38.82 
 
 		 255 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.96 
 
 		 256 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 246 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 249 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.08 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  41.57 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1634  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.213832  normal  0.261977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 254 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  33.73 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1784  putative oxidoreductase  39.92 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  37.74 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  34.13 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 255 aa  149  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.79 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>