More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5975 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5975  NAD/NADP dependent oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.8 
 
 		 255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  89.02 
 
 		 255 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.8 
 
 		 255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2755  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.87 
 
 		 259 aa  324  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.29 
 
 		 259 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.29 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.53 
 
 		 279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2051  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.92 
 
 		 255 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.641389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535154 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 		 268 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.86 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.423234  normal  0.0918658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.8 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.77 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5514  cyclopentanol dehydrogenase  40.46 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  37.12 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.43 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.61 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 267 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  36.74 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.87 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1475  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.388787  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.25 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 245 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 257 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 256 aa  144  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.28835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  38.43 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0328  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0477123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.46 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2439  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.427983  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1849  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.65 
 
 		 249 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  34.35 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1604  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.22 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.944357  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  31.37 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.731962 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3702  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.709318  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 		 244 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0883  putative dehydrogenase  37.36 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>