More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6170 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6170  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.343653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.59 
 
 		 255 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.618168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.85 
 
 		 279 aa  234  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.78 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.224785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 259 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.947162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 		 255 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.432409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2051  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.641389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5975  NAD/NADP dependent oxidoreductase  51 
 
 		 255 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2755  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.910839 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 256 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.71 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 246 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0527344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 		 250 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 		 257 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 		 246 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.3 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575966  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.95 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.791092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.730129 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 254 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  41.6 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  37.35 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 267 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.78 
 
 		 247 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43180  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 		 251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  36.29 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.71 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.585241  normal  0.0114993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2043  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2060  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.8 
 
 		 257 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.077628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.02 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  37.1 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>